抚州市有脊椎动物504种，约占全省脊椎动物的55.63%。其中鸟类238种，哺乳动物58种，两栖类32种，爬行类44种，鱼类 132种。其中珍稀物种丰富，属于国家Ⅰ级重点保护的有8种，国家Ⅱ级重点保护的有48种，属于江西省重点保护的有87种。
国家Ⅰ级重点保护野生动物有（9种）：华南虎（历史分布）、豹、云豹、梅花鹿、金雕、中华秋沙鸭、黄腹角雉、白颈长尾雉、黑鹳。
国家Ⅱ级重点保护野生动物有（48种）：猕猴、中华穿山甲、豺、黑熊、黄喉貂、大灵猫、小灵猫、金猫、水鹿、鬣羚、水獭；大鲵、虎纹蛙；小天鹅、白额雁、鸳鸯、白鹇、红腹锦鸡、勺鸡、凤头鹃隼、雀鹰、苍鹰、赤腹鹰、松雀鹰、白尾鹞、鹗、蛇雕、林鵰、鹰鵰、凤头蜂鹰、普通鵟、大鵟、小隼、红隼、燕隼、游隼、草鸮、斑头鸺鹠、长耳鸮、短耳鸮、红角鸮、领角鸮、雕鸮、鹰鸮、褐林鸮、小鸦鹃、普通夜鹰、蓝翅八色鸫。
省级重点保护野生动物有（85种）：狼、赤狐、貉、黄鼬、食蟹獴、果子狸、鼬獾、豹猫、赤麂、小麂、毛冠鹿；王锦蛇、黑眉锦蛇、三索锦蛇、灰鼠蛇、滑鼠蛇、乌梢蛇、金环蛇、银环蛇、眼镜蛇、眼镜王蛇、尖吻蝮；黑斑蛙、棘胸蛙、崇安髭蟾、泽蛙、秉螈；普通鸬鹚、小鸊鷉、风头䴙䴘、草鹭、绿鹭、池鹭、苍鹭、牛背鹭、白鹭、绿翅鸭、绿头鸭、斑嘴鸭、罗纹鸭、花脸鸭、琵嘴鸭、凤头潜鸭、青头潜鸭、红头潜鸭、普通秋沙鸭、灰雁、鸿雁、小白额雁、豆雁、雉鸡、中华鹧鸪、灰胸竹鸡、凤头麦鸡、灰头麦鸡、山斑鸠、火斑鸠、珠颈斑鸠、大杜鹃、鹰鹃、四声杜鹃、普通翠鸟、白胸翡翠、蓝翡翠、冠鱼狗、三宝鸟、戴胜、大拟啄木鸟、棕背伯劳、虎纹伯劳、红尾伯劳、牛头伯劳、黑枕黄鹂、发冠卷尾、灰卷尾、黑卷尾、红嘴蓝鹊、灰喜鹊、喜鹊、画眉、红嘴相思雀、大山雀、金腰燕、家燕、毛脚燕等。
